火焰鸟和闪电鸟都被抓走，这样一来就只剩下最后的急冻鸟了。
巫马对于三圣鸟被抓并没有那么在意，他更在意的是这个拥有战舰的人。这种战舰光是从外表上来看就足够壮观了，而且他自身的力量还能够毫不费力地捕捉三圣鸟，实在是有些恐怖。这样一艘战舰究竟会是什么人制造出来的呢。也不知道这件事和火箭队有没有关系。
此时，暴雨已经停止了，改成了下雪。由于火焰鸟和闪电鸟都被抓了，急冻鸟正在占领其他两只宝可梦的地盘。
渐战舰一直在空中追寻着急冻鸟。由于急冻鸟在不停地飞行，一时间也没能够追到。
渐渐的，天亮了。空中的乌云消失，露出了太阳。不过可以看到的是，海面上很大一部分区域都被冰给冻住了。
战舰终于追上了急冻鸟，开始对急冻鸟进行捕捉。
在战舰之中，小智也尝试着将火焰鸟和闪电鸟救出来。小智误打误撞地用皮卡丘的电、喷火龙的火和杰尼龟的水融合到一起，制造出了气体炸弹。
气体剧烈的爆炸，破坏解掉了火焰鸟身上的圆环。
火焰鸟恢复自由后，对着闪电鸟喷出了火焰，将闪电鸟的金属环也打碎了。
两只宝可梦一见面就打了起来。它们将战舰打出了一个缺口，飞了出去。接着，它们不断地进行对战舰进行攻击。战舰都受到损伤，降落在了雷之岛上。
小智几人及时地跑出去，也成功地拿到了雷属性的宝石。
三圣鸟相见之后，立刻发动了混战，相互攻击了起来。
「大家快跑！」
小智几人坐上船，赶紧离开。
就在这时，一道水龙卷忽然从海里冲了出来，卷起船只向着一个方向跑去。
巫马在旁边看三圣鸟的战斗，也不敢去插手。若是介入它们的战斗，瞬间会被打成渣。
水龙卷直接送着小智他们来到了神庙所在的岛屿上。在这里，他们遇到了一只河马王。
巫马看到河马王后，立刻飞了下来。
河马王招手说道：「将宝珠放在那边。」
大家见到河马王会说话非常的惊讶。不过见过会说话的喵喵后倒也很快接受了。
小智也顾不得太多，拿起两颗宝石跑到了神庙的祭台上。祭台上面有三个雕像，雕像分别对应着三座岛屿。
在雕像中有一个承接宝珠的地方，小智将火之宝石和雷之宝石放入了其中。
这时，河
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