个大汗和大明的皇帝不同，没有能直接号令整个蒙古的能力，这也是林丹汗继位以来一直追求统一蒙古，要恢复蒙古帝国往日荣光的主要原因。
内喀尔喀的炒花在努尔哈赤发动的战争中败落，无奈之下被迫和后金联盟，而且还和后金进行了通婚、盟约等一系列行为。这个事一出，林丹汗勃然大怒，认为炒花丢了蒙古人的脸，背叛了蒙古，起兵准备攻打内喀尔喀。
在起兵的同时，林丹汗把锡尔呼纳克杜棱洪台吉找来狠狠训斥了一顿，大骂他对内喀尔喀管束不力。
这还不算，在这事之后，林丹汗甚至怀疑起了锡尔呼纳克杜棱洪台吉，觉得炒花之所以会和努尔哈赤联盟，弄不好背后有锡尔呼纳克杜棱洪台吉的影子在，也许锡尔呼纳克杜棱洪台吉已经瞒着自己私下和努尔哈赤眉来眼去，这才是内喀尔喀背叛自己的真正原因。
因为炒花的事，林丹汗对锡尔呼纳克杜棱洪台吉起了疑心，这个疑心在后来攻击内喀尔部无功而返后越来越重，林丹汗不仅认为攻打内喀尔部落失败和锡尔呼纳克杜棱洪台吉有关，之后又在攻打科尔沁失败后，还认为锡尔呼纳克杜棱洪台吉和科尔沁方面同样也有勾结。
半年前，林丹汗就准备向锡尔呼纳克杜棱洪台吉下手了，打算在必要的时候采取措施。所谓的“必要措施”只是委婉的说法，按照阿失帖木儿的判断，这个必要措施无非就是两种，一种是把锡尔呼纳克杜棱洪台吉抓起来关押废除他的官职和台吉，第二种就是直接动手杀掉。
锡尔呼纳克杜棱洪台吉又不傻，他已经察觉到了林丹汗对自己的疑心，自然不肯坐以待毙。除去这些矛盾外，还有着宗教上的矛盾，林丹汗继位以来皈依红教，一向以红教教徒自居。但在蒙古本部包括蒙古各部落，大多信奉的又是黄教，宗教这种玩意向来就是水火不容的，一个信奉红教的大汗却领导一群信奉黄教的各蒙古部落，其中不产生矛盾才怪了呢。
随着时间的推移，林丹汗决定正式对锡尔呼纳克杜棱洪台吉下手，可没想到就在他准备下手的时候蒙古内部居然有人私下把这个事告诉了锡尔呼纳克杜棱洪台吉。
得知消息，不肯坐以待毙的锡尔呼纳克杜棱洪台吉马上就做出了决定，直接带着直属三千户脱离蒙古本部，向东进入内喀尔喀草原，投奔努尔哈赤去了。
当林丹汗知道这消息时已经晚了，锡尔呼纳克杜棱洪台吉和他的人不仅离开了蒙古本部，都已经跑到辽阳了。闻讯后林丹汗勃然大怒，在金账痛骂锡尔呼纳克杜棱洪台吉，要
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