日向朝奈自然也是村子的重点怀疑对象了。
特别是这次人体实验有团藏的手笔，日向朝奈这样的知情人团藏是绝对不会允许她活下去的。
面对团藏的追杀，日向朝奈无奈之下只能选择了叛逃。
在叛逃之前，日向朝奈返回了日向一族，将40名宗家成员杀的只剩下了6人。
而笼中鸟无法杀死日向朝奈的消息也在日向分家中蔓延开来。
日向一族也陷入了混乱之中。
没过多久，九尾之乱爆发，四代火影夫妇牺牲，宇智波一族被各种猜忌。
此时日向分家的人找上了宇智波一族。
宇智波远的鹰派和日向分家联合了起来，宇智波远和鹰派的两位长老一起，暗中潜入了日向一族将日向宗家的族人除了没有上忍校的孩子以外全部杀死。
第二天，日向分家的成员发动了政变，分家成为了日向一族的掌控者。
没了宗家日向分家就没有那么好控制了，村子高层对日向分家也有了猜忌。
村子的一些小动作，反倒是让宇智波一族和日向一族的联系越发紧密了。
两个家族一拍即合决定彻底联合起来，逼迫木叶高层让位。
他们的举动不出意外的引起了村子的动乱。
三代火影和团藏开始更加强硬的打压两个家族，最后演变成了村子和两个家族的战争。
宇智波+日向也对抗不了整个木叶，但木叶想要拿下他们也要付出惨重的代价，甚至有可能鱼死网破。
最终双方各退了一步，宇智波一族和日向一族带领愿意离开木叶的族人离开了村子。
两个家族留在木叶的忍者十不存一。
宇智波一族只剩下了157名族人，其中只有19名忍者，开启写轮眼的只有3人，宇智波鼬接任了新的宇智波一族族长的位置，鼬的好友止水自然也留了下来。
可惜没过多久，止水就莫名其妙的死亡了，唯一知道真相的宇智波鼬选择掩盖了这一切。
日向一族留下来的族人就更少了，只有70多人，还都是没有忍者天赋的普通人。
失去了两大瞳术家族，木叶越发的衰落的，几年后随着岩忍村进犯，云忍使团来到木叶逼迫木叶签订了一系列条款。
木叶只能在夹缝中求生存了。
而离开木叶的宇智波和日向一族来到了火之国首都，成为了大名的座上宾，在火之国首都定居了下来。
为
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