虎意识到因萨摩藩在庵美一国的暴政，对萨摩藩减封较多，有些过意不去，打算对萨摩藩进行一定的补偿。
鉴于萨摩藩的领国位于九州岛的最南方，为了提防葡萄牙人背弃和约再度袭扰九州沿海地区，上杉氏虎特许萨摩藩保留在种子岛（隶属大隅）的赤尾木城、屋久岛（隶属大隅）的楠川城、甑岛（隶属萨摩）的里城这三座孤悬海外的城池。同时，还允许萨摩藩保留在南日向饫肥城。
如此一来，萨摩藩就保留了内城（萨摩）、高山城（大隅）、赤尾木城（大隅）、楠川城（大隅）、里城（萨摩）、饫肥城（日向）六座城池。
在战国时期，破却的城池往往是针对在城池入口具有重大军事功能的虎口或枡形，只是破坏从外面看去最显眼的部分，并不一定要将城池全部破毁。也就是说，当时采取的做法具有先撕破「自立的领主」引以为豪的体面，再令其投降、臣服的象征意义。在这个意义上的破城举措其实肯定了大名作为领国统治者的自立性，终究流于形式，以不彻底的状态而告终。
与之相反，此次上杉将军家的破城要求完全破却除了大名居城以外的所有城池，包括领地内的兵砦，否定了大名可自行决定如何设置军
事设施的权限，就连居城也需要得到幕府的认可，置于幕府的管理之下。
而且，随后修订并颁布的《武家诸法度》在全扶桑五畿八道范围实行破城的同时，还规定大名修缮居城一事也必须事先上报至幕府。
之后，到了天正十年，幕府还要求各大名将被破毁的古城全部载入国绘图中，并将该图与明确记录居城内部构造的城绘图一并上交至幕府，由幕府进行收藏和管理。
此时，月山富田藩藩主尼子胜久破毁了除居城月山富田城之外的所有城池兵砦，并称「为尼子家的存续而行不得已之事」，令笔头家老山中幸盛也随之对居城十神山城进行破却的处理，只留高台和石垣，并让他带着家卷迁至月山富田城外的宅邸居住。
长州藩藩主毛利辉元也破毁了除本据秋城之外的山口城、高森城、山吹城、指月城、胜山城等诸多城池兵砦。
久留米藩藩主吉川元春的工作非常积极，甚至还主动「协助」田尻鉴重、黑木家永、草野镇永、蒲池鉴涟等筑后国人领主破却了蒲池城、妙见城、竹之城、猫尾城等城池兵砦。
的确，《一国一城令》是幕府对大名军事力量的规制，与此同时，各个领国也借此剥夺本家和有力家老的自立性，家臣团的家宅由此聚集在大名本
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